Curcin和curcin C与腺嘌呤互作位点的比较分析

麻疯树核糖体失活蛋白curcin和curcin C均具有抗肿瘤活性，但后者的活性水平显著高于前者，为了探索造成这一差异的结构基础，本文采用在线的同源建模预测软件SWISSMODEL，对两种麻疯树核糖体失活蛋白curcin、curcin C的三维结构模型进行预测，采用SYBYL对预测模型进行能量最小化优化，采用PROCHECK、VERIFY 3D和ERRAT软件对优化前后的模型进行质量评估，随后采用AutoDock软件将预测的模型与腺嘌呤进行分子对接分析.结果显示，两种蛋白采用与Ricin A类似的方式与腺嘌呤相互作用，但在相互作用的氨基酸残基种类、数量以及形成的氢键和疏水相互作用上还是存在差异，其中，curcin C与腺嘌呤具有最强的结合能力，curcin则最低.     

1,2,3-三唑猪去氧胆酸衍生物的合成及其对汞离子的识别性能研究

通过点击化学合成方法, 合成了一系列对金属离子具有识别作用的新型含1,2,3-三唑结构的猪去氧胆酸类人工受体. 其化学结构均经核磁共振氢谱, 核磁共振碳谱, 红外光谱, 质谱和元素分析所确证. 利用紫外可见光考察了这类型人工受体的结合性能. 结果表明, 这类分子钳对汞离子有很高的选择性和亲和性能力.     

Histories of molecules: Reconciling the past

Molecular data and methods have become centrally important to evolutionary analysis, largely because they have enabled global phylogenetic reconstructions of the relationships between organisms in the tree of life. Often, however, molecular stories conflict dramatically with morphology-based histories of lineages. The evolutionary origin of animal groups provides one such case. In other instances, different molecular analyses have so far proved irreconcilable. The ancient and major divergence of eukaryotes from prokaryotic ancestors is an example of this sort of problem. Efforts to overcome these conflicts highlight the role models play in phylogenetic reconstruction. One crucial model is the molecular clock; another is that of ‘simple-to-complex’ modification. I will examine animal and eukaryote evolution against a backdrop of increasing methodological sophistication in molecular phylogeny, and conclude with some reflections on the nature of historical science in the molecular era of phylogeny.     

钌(Ⅱ)多吡啶配合物的分子识别研究进展

钌(Ⅱ)多吡啶配合物具有丰富的光物理与电化学性质,在光化学、光物理、光催化,电化学、电子转移和能量传递、分子识别等研究领域有着广泛的应用.配合物分子识别方面的研究是当今配位化学的研究热点.评述了Ru(bpy)32+配合物及其衍生物的分子识别研究现状及最新进展.主要从pH发光传感器、阳离子识别、阴离子识别、DNA分子识别四个方面进行综述.     

晶体镍中氦泡生长的分子动力学模拟

利用分子动力学方法模拟了面心立方金属镍中氦泡的膨胀和融合过程。通过原子分布示意图、径向分布函数等方面的分析研究发现,在温度较低时,随时间的演化,原相隔五层镍原子的两氦泡逐渐聚拢,同时周围出现大量空位、间隙原子、位错等缺陷结构;两氦泡最终连为一体,氦泡周围的镍原子构成一菱形位错区域。温度较高时,两氦泡融合速度加快,融合区域增大,这对于研究材料中的杂质、缺陷、孔洞、裂纹的扩展、贯通机理具有重要意思。     

5种氨基酸缓蚀机理的量子化学及分子动力学研究

运用密度泛函理论(DFT),在B3LYP/6-31G*水平上,计算甘氨酸、亮氨酸、天冬氨酸、精氨酸及蛋氨酸5种氨基酸类缓蚀剂的前线分子轨道能量、最高占有轨道、最低空轨道的组成及各重原子的自然电荷分布、亲核Fukui指数和亲电Fukui指数.结果表明,这5种氨基酸缓蚀性能与其分子的最高占据轨道能量EHoMo及能级差△E密切相关,EHoMo越大、△E越小,其缓蚀性能越好.其次,通过分析分子最高占有轨道、最低空轨道的组成及原子的Fukui指数,探讨此类缓蚀剂分子的反应活性位点,发现这5种氨基酸是通过N、S及羰基O原子与金属形成配位键而具有缓蚀效果.运用分子动力学模拟,获得了这5种氨基酸分子与Fe(111)晶面的结合能,结合能排列顺序由大到小依次为蛋氨酸＞精氨酸＞天冬氨酸＞亮氨酸＞甘氨酸.为判断氨基酸类缓蚀剂性能的优劣,合成新型、高效氨基酸类缓蚀剂提供了理论依据.     

科研与分子生物学技术实验教学的整合

在具有众多学生的实验教学中,合理设计分配实验目标,科学安排实验内容,可以达到既对科研有益的结果,又提高加深学生对实验的认识和理解,增强学生实验的积极性。本文介绍了将一个研究发育中种子中表达转录因子DOF基因项目的两个基因在不同花生品种中的克隆安排在分子生物学实验技术的实验教学课程"基因工程"中,按照研究所用技术,次序进行DNA提取、PCR、琼脂糖凝胶电泳和特异DNA从凝胶中的回收、PCR产物与T载体的连接、感受态细胞的制备、重组载体的转化、重组菌的筛选和鉴定一系列相互联系的实验,使分离的实验技术形成了完整的体系。使整个实验课程即具有技术教学的特点,又具有科学研究的整体意义,前后结果相互联系,使学生兴趣盎然,教学效果大幅度提高。     

本科生分子生物学实验教改中存在的问题及对策

作者结合自己分子生物学实验教学经验,介绍了教研室本科生分子生物学实验教学改革现状,肯定了实验教学改革效果,同时对改革中存在的问题进行深入分析,并提出相应对策。     

超冷分子实验方法探究

将分子的冷却分为直接冷却和间接冷却,并分别对直接冷却机制下的缓冲气体冷却、分子Stark减速冷却和蒸发协同冷却,间接冷却机制下的光缔合技术、光学Feshbach共振技术和磁场可调谐的Feshbach共振技术进行了描述。